Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms