Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms