Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms