Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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