Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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RPE65Q16518 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPE65Q16518 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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RPE65Q16518 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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RPE65Q16518 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPE65Q16518 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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RPE65Q16518 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPE65Q16518 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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