Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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