Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms