Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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C1orf61Q13536 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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