Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME3Q13232 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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NME3Q13232 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME3Q13232 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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