Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms