Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
POLEQ07864 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
POLEQ07864 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
POLEQ07864 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms