Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL3P58872 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms