Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HK3P52790 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HK3P52790 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HK3P52790 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HK3P52790 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HK3P52790 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HK3P52790 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HK3P52790 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HK3P52790 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HK3P52790 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HK3P52790 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HK3P52790 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HK3P52790 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HK3P52790 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms