Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms