Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms