Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms