Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPLO60437 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPLO60437 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPLO60437 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPLO60437 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPLO60437 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPLO60437 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPLO60437 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPLO60437 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPLO60437 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPLO60437 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPLO60437 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPLO60437 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPLO60437 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPLO60437 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms