Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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