Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms