Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX6Q9UNH7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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