Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms