Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms