Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C11orf49Q9H6J7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms