Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms