Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms