Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms