Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms