Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms