Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
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SYCP1Q15431 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SYCP1Q15431 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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SYCP1Q15431 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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SYCP1Q15431 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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SYCP1Q15431 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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SYCP1Q15431 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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SYCP1Q15431 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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SYCP1Q15431 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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SYCP1Q15431 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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SYCP1Q15431 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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