Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms