Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms