Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms