Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms