Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms