Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRAFP15056 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRAFP15056 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRAFP15056 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRAFP15056 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRAFP15056 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRAFP15056 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BRAFP15056 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BRAFP15056 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
BRAFP15056 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRAFP15056 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRAFP15056 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms