Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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