Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A8Q9C0K1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A8Q9C0K1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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