Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms