Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms