Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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USP47Q96K76 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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USP47Q96K76 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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USP47Q96K76 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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USP47Q96K76 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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USP47Q96K76 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP47Q96K76 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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