Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RASSF3Q86WH2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms