Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms