Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms