Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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