Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms