Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
POLEQ07864 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
POLEQ07864 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
POLEQ07864 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
POLEQ07864 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
POLEQ07864 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
POLEQ07864 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
POLEQ07864 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
POLEQ07864 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms