Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 685.2 ms