Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPAP53621 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPAP53621 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms