Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RECQLP46063 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RECQLP46063 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RECQLP46063 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RECQLP46063 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RECQLP46063 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RECQLP46063 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RECQLP46063 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RECQLP46063 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RECQLP46063 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RECQLP46063 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RECQLP46063 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RECQLP46063 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RECQLP46063 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RECQLP46063 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RECQLP46063 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RECQLP46063 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RECQLP46063 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RECQLP46063 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RECQLP46063 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RECQLP46063 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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