Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms